Biodiversiteettiyksikkö on biologian laitoksen alainen tukiyksikkö, johon kuuluvat kasvimuseo, kasvitieteellinen puutarha, eläinmuseo ja Perämeren tutkimusasema.
Yksikkö hoitaa, ylläpitää ja kartuttaa yliopiston yli 2,5 miljoonan näytteen museo- sekä n. 5500 taksonin eläviä biodiversiteettikokoelmia.
Yksikön vastuulla on myös biologian laitoksen opintokokoelmien ja tutkimuskasvatusten hoito. Lisäksi yksikkö ylläpitää Krunnien kenttäasemaa Perämerellä sekä biologian laitoksen maastokalustoa (veneet, moottorikelkat ym).