Museon tutkimus on profiloitunut pohjoisille alueille ja se kattaa laajasti biologiseen monimuotoisuuteen liittyviä kysymyksiä.

Erityisesti Pohjois-Suomen kasvistotutkimus, uhanalaisten sienten ja kasvien taksonominen ja ekologinen tutkimus ovat keskeisiä tutkimusteemoja.

Tällä hetkellä tutkimuskohteina ovat seuraavat aihepiirit: 

• Kasvien ja sienten DNA-tunnisteet
• Lajien levinneisyys ja ekologia
• Lajien ja luontotyyppien uhanalaisuus sekä monimuotoisuuden säilyttäminen

Kuvassa ruijanesikko (Primula nutans). Kuva Lassi Kalleinen & Leena Holmström