Fonetiikalla on opetukseen ja tutkimukseen liittyvää yhteistyötä erityisesti logopedia-oppiaineen kanssa; opetukseen liittyvää yhteistyötä on myös yleisen kielitieteen kanssa.

Tutkimusyhteyksiä fonetiikalla on mm. Tallinnan kybernetiikan instituutin kanssa (Institute of Cybernetics at Tallinn University of Technology (IoC)).