Opetuksen ja tutkimustoiminnan hoitoa varten konetekniikan osasto on jaettu kuuteen laboratorioon, jotka on esitetty seuraavassa rakennekaaviossa. Osastoa johtaa osastonjohtaja yhdessä OSASTON JOHTORYHMÄN, OPETUKSEN KEHITTÄMISTYÖRYHMÄN ja TUTKIMUKSEN EDISTÄMISTYÖRYHMÄN kanssa. Osastoon kuuluu lisäksi toimisto, opintoneuvoja ja konepaja.

Laboratorioiden tehtävänä on antaa ja valvoa oppialaansa kuuluvien aineiden opetusta, seurata alansa tiedon ja tieteen sekä kansallista että kansainvälistä kehitystä ja edistää oman alansa tutkimustoimintaa.