Tiedekunnan osastot ovat mukana useissa valtakunnallisissa tutkijakouluissa ja osastoilla on käynnissä myös omia tutkijakouluja. Tiedekunta järjestää yhteisiä jatko-opintokursseja ja panostaa väitöskirjatöiden loppuvaiheen rahoitukseen. Arkkitehtuurin osasto vastaa valtakunnallisesta Moderni puukaupunki -tutkijakoulusta. Infotech Oulun tutkijakoulu antaa informaatiotekniikan alan tohtorintutkintoon tähtäävää jatkokoulutusta.
Teknillisessä tiedekunnassa koordinoituja tutkijakouluja:
Environet ympäristötohtorikoulu
Oulun yliopistoon on perustettu koko yliopiston laajuinen tutkijakoulu (University of Oulu Graduate School, UniOGS), joka on aloittanut toimintansa 1.8.2011.
Oulun yliopiston tutkijakoulu (UniOGS)