Väitöstilaisuus Oulun yliopistossa

Väittelijä

Master of Animal Breeding and Genetics Jihan Xia

Tiedekunta ja yksikkö

Oulun yliopiston tutkijakoulu, Biokemian ja molekyylilääketieteen tiedekunta, FBMM

Oppiaine

Biokemia ja molekyylilääketiede

Väitöstilaisuus

20.12.2019 12:00

Väitöstilaisuuden paikka

Auditorio F202, Aapistie 5 B, Oulu

Aihe

Kolmen riskiä lisäävän geneettisen muutoksen molekyylimekanismi ja biologia eturauhassyövässä

Vastaväittäjä

PhD, Assistant Professor Jian Yan , Department of Biomedical Sciences, City University of Hong Kong

Kustos

FT, professori Gonghong Wei, Oulun yliopisto

Kolmen riskiä lisäävän geneettisen muutoksen molekyylimekanismi ja biologia eturauhassyövässä

Tämä väitöskirja käsittelee integroituja korkean suoritustehon metodeja ja suuria tietoaineistoja kymmenien eturauhassyövän lokuksien analysoimiseen. Merkittävimmät kohteet ovat kolmen eturauhassyövälle altistavan SNP-markkerin – (1) rs13215402 (6q25):n, (2) rs6579003:n, rs7123299:n ja rs7123418:n (11p15) sekä (3) rs11672691:n (19q13) – funktionaalisessa luonnehdinnassa. Mainituista markkereista viimeisimmällä on löydetty olevan yhteys myös eturauhassyövän aggressiivisuuteen.

Löysimme SNP:iden sijoittuvan funktionaalisten transkription tehostajien yhteyteen, jotka ovat vahvistettuja H3K4me1:n ja H3K27ac:n epigeneettisellä koodilla. Lisäksi löysimme merkittävien eturauhasen transkriptiotekijöiden, AR:n, FOXA1:n ja HOXB13:n, sekä uudentyyppisen transkriptiosäätelijä HOXA2:n kytkeytyminen SP- markkeriin rs11672691. eQTL-analyysit paljastivat merkittävän yhteyden rs13215402:n genotyypillä RGS17:n ilmentymisessä, rs6579003:n, rs7123299:n ja rs7123418:n haplotyypillä ASCL2:n ilmentymisessä ja rs11672691:llä PCAT19:n ja CEACAM21:n ilmentymisessä. Lisäksi CRISPR/Cas9-välitteinen yhden emäksen muuttaminen yksittäisessä solussa toi esille rs13215402:n genotyypin suoran vaikutuksen RGS17:n ilmentymiseen ja rs11672691:n merkittävän roolin PCAT19:n ja CEACAM21:n ilmentymisessä sekä eturauhassyövän aggressiivisessa fenotyypissä. Kliininen data ennakoi, että RGS17:n, HOXA2:n tai PCAT19:n lisääntynyt ekspressio eturauhassyövän näytteissä on yhteydessä kasvaimen kehittymiseen, pahanlaatuisuuteen ja lisääntyneiden oireiden uusiutumisriskiin. Me havaitsimme synergistisen vaikutuksen alleeli rs11672691:n (19q13) ja PCAT19/CEACAM21:n geeniekspression välillä eturauhassyövän ennusteessa.

Viimeksi päivitetty: 16.12.2019