Sini Skarp

MSc

PhD Student
Genetics of musculoskeletal diseases

Yhteensä 9 vertaisarvioitua julkaisua kansainvälisissä lehdissä. Julkaisujen yhteenlaskettu siteerausmäärä 31, joista eniten siteerattu julkaisu 6. Julkaisujen h-indeksi on 4.00. (Google Scholar)

Biografia

Sini Skarpin väitöskirjatyö tarkastelee tuki- ja liikuntaelinsairauksien perintötekijöitä Suomalaisissa perheaineistoissa. Tutkimus keskittyy tunnistamaan tuki- ja liikuntaelinsairaiuksille altistavia perintötekijöitä käytten koko eksomin sekvensointia sekä in vitro kokeita. Sini työskennellyt myös Pohjois-Suomen syntymäkohorteissa genominlaajuisten assosiaatioanalyysien parissa sekä perhetynyt cDNA microarray aineistohen analyysiin.

Tutkimusaiheet

  • Genetics of common diseases
  • Next generation sequencing
  • Musculoskeletal diseases

Social media

Valikoidut julkaisut

  • Skarp, Sini; Kämäräinen, Olli-Pekka; Wei, Gong-Hong; Jakkula, Eveliina; Kiviranta, Ilkka; Kröger, Heikki; Auvinen, Juha; Lehenkari, Petri; Ala-Kokko, Leena; Männikkö, Minna (2018) Whole exome sequencing in Finnish families identifies new candidate genes for osteoarthritis. - PLoS One 13 (8), e0203313 . [Original] [Self-archived]
  • Kraatari, Minna; Skarp, Sini; Niinimäki, Jaakko; Karppinen, Jaro; Männikkö, Minna (2017) A Whole Exome Study Identifies Novel Candidate Genes for Vertebral Bone Marrow Signal Changes (Modic Changes). - Spine 42 (16), 1201–1206 . [Original] [Self-archived]
  • Sliz, Eeva; Taipale, Mari; Welling, Maiju; Skarp, Sini; Alaraudanjoki, Viivi; Ignatius, Jaakko; Ruddock, Lloyd; Nissi, Ritva; Männikkö, Minna (2017) TUFT1, a novel candidate gene for metatarsophalangeal osteoarthritis, plays a role in chondrogenesis on a calcium-related pathway. - PLoS One 12 (4), e0175474 . [Original] [Self-archived]
  • Costantini, Alice; Skarp, Sini; Kampe, Anders; Mäkitie, Riikka E.; Pettersson, Maria; Männikkö, Minna; Jiao, Hong; Taylan, Fulya; Lindstrand, Anna; Mäkitie, Outi (2018) Rare Copy Number Variants in Array-Based Comparative Genomic Hybridization in Early-Onset Skeletal Fragility. - Frontiers in Endocrinology 9, 380 . [Original]