Matemaattisten tieteiden laitoksella tutkimusalat ovat jaettu neljään pääluokkaan. Kukin luokka rakentuu useasta erilaisesta osa-alueesta, joita lueteltu lyhyesti luokan alapuolella.
- Algebrat
- Analyysi
- Differentiaaliyhtälöt
- Epälineaarinen analyysi
- Funktionaalianalyysi
- Operaattoriteoria
- Harmoninen analyysi
- Inversio-ongelmat
- Diofantoksen approksimaatiot
- Ei-assosiatiiviset binääriset rakenteet
- Kombinatoriikka
- Ryhmäteoria
- Äärelliset kunnat
- Koodausteoria
- Kuvankäsittely
- Kryptografia ja salausmenetelmät
- Tilastollinen hahmontunnistus
- Informaation visualisointi
- Biometria (erityisesti biologiset, lääketieteelliset ja metsätieteelliset sovellukset)
- Ekonometria ja aikasarja-analyysi
- Parametriton funktioiden estimointi
- Pitkittäisaineistojen ja spatiaalisten ainestojen tutkimus
- Scale Space -menetelmät