Suurin osa Oulun yliopiston Japani-orientoituneista tutkijoista tulee historiatieteiden oppiaineen parista. Painotus näkyy sekä julkaisuissa että lähdesarjoissa.
Historiatieteissä erityisiä Japania koskevia painopistealueita ovat: Japanin miehityskausi 1945-1952, lähetystyö Japanissa, keisarius kulttuurisena ja yhteiskunnallisena symbolina, Japanin kulttuurin ja yhteiskunnan kuva länsimaisen kulttuurin piirissä.