Giellagas -instituutin opetukselle on tärkeää, että opettajilla ja opiskelijoilla on hyvät yhteydet muihin oppilaitoksiin, joiden kanssa on mahdollista tarjota monipuolista opetusta saamelaisten kulttuurista ja kielestä. Merkittäviä yhteistyökumppaneita ovat muiden muassa Saamelaisalueen koulutuskeskus Inarissa, Saamelainen korkeakoulu Norjan Koutokeinossa, Lapin yliopisto (mm. Arktinen keskus) Rovaniemellä ja Avoin yliopisto Oulun yliopistossa.