Arkeologiassa voi suorittaa jatkotutkintona filosofian tohtorin (FT) tutkinnon. Tutkinnon keskeinen osa on väitöskirja, jota puolustetaan julkisessa väitöstilaisuudessa. Tutkintoon kuuluu myös 20-50 opintopisteen verran muita opintoja. Opintojen määrästä sovitaan erikseen. Filosofian lisensiaatin (FL) tutkinto on vapaaehtoinen. Arkeologian jatko-opiskelijat ovat myös Oulun yliopiston tutkijakoulun opiskelijoita.

Ennen jatko-opiskelijaksi hakeutumista on tärkeää keskustella oppiaineen professorin kanssa tutkimusaiheesta ja siitä, onko suunniteltu tutkimusaihe sellainen, josta oppiaineessa löytyy riittävästi asiantuntemusta ohjaamiseen. Käynnissä olevissa tutkimusprojekteissa tehdään väitöskirjatutkimusta ja annetaan ohjausta.