Solunulkoisten vesikkelien karakterisointi solumalleista ja biologisista nesteistä syövän ja infektiotautien ei-invasiiviseen diagnostiikkaan
Väitöstilaisuuden tiedot
Väitöstilaisuuden päivämäärä ja aika
Väitöstilaisuuden paikka
F101, Aapistie 7, University of Oulu
Väitöksen aihe
Solunulkoisten vesikkelien karakterisointi solumalleista ja biologisista nesteistä syövän ja infektiotautien ei-invasiiviseen diagnostiikkaan
Väittelijä
Lääketieteen lisensiaatti Artem Zhyvolozhnyi
Tiedekunta ja yksikkö
Oulun yliopiston tutkijakoulu, Biokemian ja molekyylilääketieteen tiedekunta, Tautiverkostot
Oppiaine
Solunulkoisten vesikkelien karakterisointi solumalleista ja biologisista nesteistä syövän ja infektiotautien ei-invasiiviseen diagnostiikkaan
Vastaväittäjä
Apulaisprofessori Hadi Valadi, Göteborgin yliopisto
Kustos
Professori Seppo Vainio, Oulun yliopisto
Solunulkoisten vesikkelien karakterisointi solumalleista ja biologisista nesteistä syövän ja infektiotautien ei-invasiiviseen diagnostiikkaan
Ei-invasiivinen, reaaliaikainen terveydentilan seuranta rajoittuu tällä hetkellä vain harvoihin parametreihin, ja erityisesti syövän kohdalla tarvitaan parempia diagnostiikkamenetelmiä. Nestebiopsia mahdollistaa sairauksien biomarkkereiden tunnistamisen ruumiinnesteistä, kuten verestä tai virtsasta, ja tarjoaa siten merkittäviä mahdollisuuksia varhaisen diagnostiikan kehittämiseen. Solujen vapauttamat solunulkoiset vesikkelit (EV:t) sisältävät monenlaisia analyyttejä, kuten proteiineja, lipidejä, metaboliitteja ja RNA-lajeja, mikä tekee niistä potentiaalisia biomarkkereita nestebiopsiaan. Hiki, jota erittyy jatkuvasti, tarjoaa edun "reaaliaikaisesta" tiedosta ei-invasiivista analyysiä varten. Sen diagnostista potentiaalia on toistaiseksi tutkittu varsin vähän.
Tämän projektin tavoitteena on karakterisoida hien ja solumallien EV:iden molekyylikoostumusta mahdollisten kasvainten biomarkkereiden tunnistamiseksi. Projektissa kehitetään EV-eristysmenetelmiä sekä suurista että pienistä ihmisen hikinäytteistä, tutkitaan EV-rikkaiden hikinäytteiden nukleiinihappo- ja proteiinikoostumusta sekä kehitetään Raman-spektroskopiaan (RS) perustuvia menetelmiä syöpäsoluperäisten EV:iden karakterisointiin. Proteomiikkaa, aikaportitettua Raman-spektroskopiaa (TG-RS) ja pintavahvistettua aikaportitettua Raman-spektroskopiaa (TG-SERS) käytettiin arvioitaessa hypoksiakäsittelyn vaikutuksia munuaissolukarsinoomasta (RCC) peräisin olevien EV-näytteiden molekyylikoostumukseen.
Tuloksemme osoittavat, että hien EV:itä voidaan hyödyntää ei-invasiivisena biomarkkerilähteenä sekä ihmis- että bakteeriperäisille aineille. Lisäksi kaupallisesti saatavilla olevien alginaattilaastareiden käyttö hikeä kerättäessä tuottaa riittävästi biologista materiaalia molekyylikoostumuksen analysointiin, poistaa tarpeen voimakkaalle fyysiselle rasitukselle ja mahdollistaa ihmisperäisten proteiinien selektiivisen keräämisen.
Tämän projektin tavoitteena on karakterisoida hien ja solumallien EV:iden molekyylikoostumusta mahdollisten kasvainten biomarkkereiden tunnistamiseksi. Projektissa kehitetään EV-eristysmenetelmiä sekä suurista että pienistä ihmisen hikinäytteistä, tutkitaan EV-rikkaiden hikinäytteiden nukleiinihappo- ja proteiinikoostumusta sekä kehitetään Raman-spektroskopiaan (RS) perustuvia menetelmiä syöpäsoluperäisten EV:iden karakterisointiin. Proteomiikkaa, aikaportitettua Raman-spektroskopiaa (TG-RS) ja pintavahvistettua aikaportitettua Raman-spektroskopiaa (TG-SERS) käytettiin arvioitaessa hypoksiakäsittelyn vaikutuksia munuaissolukarsinoomasta (RCC) peräisin olevien EV-näytteiden molekyylikoostumukseen.
Tuloksemme osoittavat, että hien EV:itä voidaan hyödyntää ei-invasiivisena biomarkkerilähteenä sekä ihmis- että bakteeriperäisille aineille. Lisäksi kaupallisesti saatavilla olevien alginaattilaastareiden käyttö hikeä kerättäessä tuottaa riittävästi biologista materiaalia molekyylikoostumuksen analysointiin, poistaa tarpeen voimakkaalle fyysiselle rasitukselle ja mahdollistaa ihmisperäisten proteiinien selektiivisen keräämisen.
Viimeksi päivitetty: 17.10.2025