Johannes Kettunen

Multiomiikka ja systeeminen lääketiede terveystutkimuksessa

Prof. Johannes Kettunen

Johannes Kettunen

FT

Professori
Genetiikka ja biostatistiikka

Yhteensä 80 vertaisarvioitua julkaisua kansainvälisissä lehdissä. Julkaisujen yhteenlaskettu siteerausmäärä 10810, joista eniten siteerattu julkaisu 1719. Julkaisujen h-indeksi on 35.00. (Web of Science)

Biografia

Yliopistotutkija Johannes Kettunen johtaa laskennallisen lääketieteen tutkimusryhmää Oulun yliopistossa, ja hän hoitaa akatemiatutkijan toimea. Johannes on genetiikan tohtori ja dosentti. Hänen tutkimus liittyy isojen moni-omiikka aineistojen hyödyntämiseen epidemiologisessa tutkimuksessa. Hän on johtanut lukuisia töitä tällä saralla ja julkaissut yli 80 artikkelia kansainvälisissä vertaisarvioiduissa julkaisusarjoissa. Näihin julkaisuihin on viitattu yli 10,000 kertaa. Tämän hetkinen tutkimus keskittyy kokonaiskuolleisuuden biomarkkereiden patofysiologian ymmärtämiseen. Johannes johtaa myös Biocenter Oulun tutkimusryhmää (2016-).

Tutkimusaiheet

  • Genetiikka ja kausaalisuhteiden arviointi
  • Multiomiikka epidemiologiassa
  • Systeeminen lääketiede

Menossa oleva ulkopuolinen rahoitus

Suomen akatemia, Akatemiatutkija, 2016-2021

Novo Nordisk Fonden, nuoren tutkijan apuraha, 2017-2022

Tietokannat

Tieteelliset ansiot

Valikoidut julkaisut

  • Fischer, Krista; Kettunen, Johannes; Würtz, Peter; Haller, Toomas; Havulinna, Aki S; Kangas, Antti J; Soininen, Pasi; Esko, Tonu; Tammesoo, Mari-Liis; Mägi, Reedik; Smit, Steven; Palotie, Aarno; Ripatti, Samuli; Salomaa, Veikko; Ala-Korpela, Mika; Perola, Markus; Metspalu, Andres (2014) Biomarker profiling by nuclear magnetic resonance spectroscopy for the prediction of all-cause mortality : an observational study of 17,345 persons. - PloS Medicine 11 (2), e1001606 . [Original]
  • Kettunen, Johannes; Demirkan, Ayse; Würtz, Peter; Draisma, Harmen H. M.; Haller, Toomas; Rawal, Rajesh; Vaarhorst, Anika; Kangas, Antti J.; Lyytikäinen, Leo-Pekka; Pirinen, Matti; Pool, Rene; Sarin, Antti-Pekka; Soininen, Pasi; Tukiainen, Taru; Wang, Qin; Tiainen, Mika; Tynkkynen, Tuulia; Amin, Najaf; Zeller, Tanja; Beekman, Marian (2016) Genome-wide study for circulating metabolites identifies 62 loci and reveals novel systemic effects of LPA. - Nature Communications 7, 11122 . http://doi.org/10.1038/ncomms11122.
  • Ritchie, Scott C; Würtz, Peter; Nath, Artika P; Abraham, Abraham; Havulinna, Aki S; Fearnley, Liam G; Sarin, Antti-Pekka; Kangas, Antti J; Soininen, Pasi; Aalto, Kristiina; Seppälä, Ilkka; Raitoharju, Emma; Salmi, Marko; Maksimow, Mikael; Männistö, Satu; Kähönen, Mika; Juonala, Markus; Ripatti, Markus; Lehtimäki, Terho; Jalkanen, Sirpa (2015) The biomarker GlycA is associated with chronic inflammation and predicts long-term risk of severe infection. - Cell systems 1 (4), 293-301
  • Ahola-Olli, Ari V.; Würtz, Peter; Havulinna, Aki S.; Aalto, Kristiina; Pitkänen, Niina; Lehtimäki, Terho; Kähönen, Mika; Lyytikäinen, Leo-Pekka; Raitoharju, Emma; Seppälä, Ilkka; Sarin, Antti-Pekka; Ripatti, Samuli; Palotie, Aarne; Perola, Markus; Viikari, Jorma S.; Jalkanen, Sirpa; Maksimow, Mikael; Salomaa, Veikko; Salmi, Marko; Kettunen, Johannes (2017) Genome-wide Association Study Identifies 27 Loci Influencing Concentrations of Circulating Cytokines and Growth Factors. - American journal of human genetics 100 (1), 40-50 .
  • Würtz, Peter; Wang, Qin; Soininen, Pasi; Kangas, Antti J.; Fatemifar, Ghazaleh; Tynkkynen, Tuulia; Tiainen, Mika; Perola, Markus; Tillin, Therese; Hughes, Alun D.; Mäntyselkä, Pekka; Kähönen, Mika; Lehtimäki, Terho; Sattar, Naveed; Hingorani, Aroon D.; Casas, Juan-Pablo; Salomaa, Veikko; Kivimäki, Mika; Järvelin, Marjo-Riitta; Smith, George Davey; Vanhala, Mauno; Lawlor, Debbie A.; Raitakari, Olli (2016) Metabolomic Profiling of Statin Use and Genetic Inhibition of HMG-CoA Reductase. - Journal of the American College of Cardiology 67 (10), 1200-1210 . http://dx.doi.org/10.1016/j.jacc.2015.12.060.

Ohjauskokemus

Johannes on ohjannut kolme väitöskirjaa valmiiksi, lisäksi hän ohjaa kuutta väitöskirjatyöntekijää tällä hetkellä.